目前，同仁堂健康药业公司已经在全国拥有统一规范管理的专营店、店中店六百多家。这些店都装修得既有同仁堂的共性，又有自己的个性；既有让高端顾客感到满意的购物环境，又能让普通消费者感受到亲和力。健康药业公司在大型综合店（旗舰店）中还增加了中医坐堂、饮片销售等项目。这些做法使得同仁堂的品牌形象得到进一步提升，也让消费者可以方便、放心地购买到货真价实的产品。健康药业的成功，还在于积极使用现代高科技手段，他们大量采用电脑、ＰＤＡ等数字化设备，实现信息化管理，保证了这种销售模式的有效运转。

由于健康药业得到了同仁堂集团的大力支持，同时又敢于创新，因而发展得很快，从２００２年健康药业公司成立，收入不足两亿元起步，到２００８年底就达到了二十四亿元，可称得上是目前同仁堂效益最好的企业之一。

除了和外商合资，同仁堂集团还有一种“门当户对”的合作模式，就是国有企业和国有企业合资。过去同仁堂的零售店只有大栅栏一家，真正是“只此一家，别无分号”。可是市场经济发展了，没有销售终端，就没有生存的根基，也就很难进一步发展。２００３年，同仁堂集团和北京首创科技投资有限公司、海王集团等国内企业共同出资五千万元，成立了“北京同仁堂商业投资发展有限公司”。这家公司就是为了大力发展同仁堂的零售网点，作为控股公司的同仁堂集团持股６６％。这种和国内有实力的企业结成战略伙伴的做法，为零售网点的发展提供了有力的资金保证。这样的合作是优势互补，强强联合，必然会迎来双赢的局面。现在，同仁堂的销售终端，包括海外部分，已经有上千家。

安徽有个名扬古今的亳州市，这里是“神医”华佗的故里。因为种植、经营中药材已经有两千多年的历史，又有“药都”之称，可称得上是中医药文化的摇篮。近年来全市中药材种植面积已发展到一百多万亩，有四百多个品种，从事种植、加工、购销中药材的人员达百万人之众。

这天，亳州来了一批北京客人，他们就是同仁堂来考察的。亳州的药农知道了这个消息说：“从前祁州药市有个规矩，同仁堂不到不开市，因为他们进货的量很大，资本雄厚。现在同仁堂又到亳州来了，咱们的药就不愁卖不出去了。”

“亳州自古是兵家必争之地，现在又是药厂必争之地。那些大客户把药价压一压，我们这些种药的，就要亏很多；要是稍微往上抬一抬，我们又可以赚不少。不知同仁堂来了会怎么样。”

同仁堂到亳州不是来压价或抬价的，他们是来和亳州谈合作双赢的。原来，同仁堂集团在通县有个饮片厂，这个饮片厂刚建成就面临着亏损的局面。因为当时乡镇企业如雨后春笋般发展起来，通县饮片厂虽然设备好、工艺先进、产品质量好，却难以和那些劳动力低廉的乡镇企业争夺市场。因此，在股改上市后，便转产小儿清脾丸、小儿清肺丸、清音丸等成药了。不过，同仁堂集团的领导非常明白，饮片是顾客非常需要的，市场前景看好。虽然通县的饮片厂转产了，但无论是为了尽自己的社会责任，还是为了企业赢利，同仁堂都要加强饮片的生产销售。

经过考察和调研，同仁堂集团的领导决定，在亳州这个“药都”作文章。这里种植的药材质量好，数量大，又是全国闻名的药市，必有可为；但是这里的药材大都是生药，没有经过加工，附加值低。如果和这里的企业合作建立饮片厂，再凭借着“同仁堂”的品牌，不仅会给同仁堂带来效益，还可以提高当地药材的附加值，有利于药农，有利于合作伙伴，有利于地方经济的发展。这个多方获益的合作方案，自然受到了亳州药农、企业和地方政府的欢迎。同仁堂集团根据亳州的具体情况，决定由同仁堂集团旗下的北京同仁堂药材有限公司与这里的民营企业作为合作伙伴。同仁堂用当地的药材和劳动力，成本比北京的要低，同时又用同仁堂的质量标准和管理办法，提高了当地的产品质量，实现了双赢。此后，同仁堂药材有限公司又和内蒙古、湖南联合，建立药材生产供应基地，规模越来越大，效益越来越突出。同仁堂在体制创新中，又创出了一个新的模式，就是国企和民企合资。这种合作对同仁堂以及地方经济的发展都起到了促进作用。