另外戴笠还要军统局坚决贯彻他提出的“裁弱留强，里外三百”意图的同时，在内部体制上减少指挥层次，下令撤消所有区一级的组织，恢复在省范围内以省站为最高指挥机关。原来归属区一级指挥的特务人员，在绝对保密的情况下全部转入地下，不再以公开机关和任何名义作掩护。在此基础上，戴笠迅速清理整顿军统内部的贪污受贿问题，以免被蒋介石和政敌抓住口实。他指示毛人凤成立一个财产清理委员会，自己也迅速到各地去清理财产。

蒋介石收到这份计划的时候，心中还有一些疑问。因为他不相信戴笠会这么干脆地做出对他力量如此不利的削减。所以他表面上对戴笠的决定表示肯定，但是私底下却派人继续调查。这一查却发现了诸多的疑点。

首先戴笠虽然削减了军统局内部的军事部门，却掌握了军令部第二厅，把军事情报、军事稽查业务以及军队中各级谍报参谋方面的力量都拨归进去，全部抓到手中，成立军事特工方面的独立系统。

其次戴笠掌握了内政部警政司，并将警政司扩编为内政部的警察总署，把军统局原先主管的特工警察力量划拨过去，形成警察行政业务与警察特工业务一把抓。

戴笠另外改编了忠义救国军和军统局的特务团，再加上军委会的别动军、交通警备司令部所属的各团、交通巡警总队和军统局掌握的部分国民党税警部队，把约10万人组建成了交通警察总局。

尽管戴笠削减了各内外勤机构，但是他并没有解散削减下来的人员，而是把这些人安插到各个司法行政部门，形成军统化整为零后的基本力量。同时也成立了一个调查室，安顿下军统局主脑部分的主脑部分。

最让蒋介石气愤的是戴笠竟然默许军统内部成立一个叫“警坛社”的秘密组织。而该组织成立的目的甚至是明确地表示要争夺全国的警察大权。经过这几步计划，军统力量没有被削弱，反而比原来还要更加强大。

这个消息传到了蒋介石耳中，他沉默了很久，最后愤愤不平地说：“这个戴科长闹昏头了，他得明白他自己的位置。”