将神木放诸更大层面，在向来贫困的陕北，单方面提高标准的政治风险就不言而喻了。从国家角度，医疗是整体性的，这是医改推进缓慢的原因。神木在财政大跃进下的福利大跃进，引起了一些方面的担忧——担心其会殃及整体医改。在本来贫富悬殊的榆林，神木的异军突起，也加大了其他贫困县的压力。

对福利鸿沟的制造和扩大更敏感的，除了榆林，还有国家财政部。神木医改的舆论动静一大起来，财政部的人马上就坐不住了。对于神木的草率和鲁莽，他们直接发出了最为明确的反对声音。

2009年5月27日，在神木医改舆情鼎沸的时候，一支调研小组进驻神木。这支由财政部副部长王军直接组织委任的调查组被要求对这场为社会广泛关注的“全民免费医疗”进行全面摸底。

几个月后呈交到财政部的题为《揭开神木医改的神秘面纱》的调研报告里，调研干部们从管理制度的设计上肯定了神木方，指出医改的费用支出控制和秩序都运行良好，但报告的重点显然在于后半部分，执笔干部认为：“神木医改”完全不可复制和持续。

报告引用了一名神木财政局受访局长的观点：“最近几年神木地方财政收入增长较快，加上预算外收入，目前全县可支配财力达到40亿元左右。神木的经济实力，源于其境内丰富的资源。刘局长说，全县煤炭探明储量500亿吨，是全国第一产煤大县。按照目前每年开采1亿吨计算，可开采500年，保守估计也要开采200年。同时，县域内还有丰富的石英砂、铁矿石、石灰石等资源。县财政预算安排1.5亿元用于实施‘全民免费医疗’，从目前制度运行情况看，应能满足支出需要。全县每年用于城建的支出就达10多亿元，即使‘全民免费医疗’出现超支，我们完全可以通过追加预算解决，哪怕砍掉几个代表‘形象工程’的城建项目，也要确保民生领域的支出。但另一方面，因为这些年煤炭业的高速发展，煤矿沉陷区治理、防沙治沙的支出需求呈大幅增长之势，也给县财政带来很大压力，可以预见，这些方面的支出压力在未来还会持续增长，势必影响财政对医疗等领域的支持。”