北洋政府为了扑灭“五四”烈火，一方面为卖国贼洗脱罪行，一方面继续污蔑学生的爱国运动是“纵火伤人”、“举动越轨”、“以爱国始，以祸国终”，甚至说学生已经构成非法行为，下令“即日一律上课”，对不听从命令者扬言要逮捕法办。政府的这一所为，再次激怒了广大学生，6月3日，学生再次上街游行、演说，被当局逮捕了181人。邵飘萍无法容忍政府的卑劣行径，6月4日，发表署名文章《为学生事警告政府》，称：“政府当知对人，而不知对事；但知打肤浅之官话，而不肯视为重大问题加以细密之研究。”“唤醒政府勿再专事对人敷衍，以益使风潮扩大。”政府不顾社会舆论，于4日再次逮捕700多名学生。学生没有被吓到，5日五千多学生再次爆发大型游行运动。邵飘萍继续用他犀利的文章，严厉指责政府袒护卖国贼，镇压爱国学生的丑恶行径。

学联成立后，拒签运动在全国勃起。邵飘萍又撰写了《和约签字后如何》、《今之所为公理》、《挽回而后签字乎抑袖手以待签字乎》、《我国不签字之影响》、《拒绝签约后之一致》、《望主张不签字者之奋起》等评论，就签字不签字的利弊影响，签字与不签之后怎么办，签字不签字的根本原因等诸多方面进行论述，诚告国人不要迷信公理之说，不要对列强抱有幻想。中国拒签巴黎和约，国际反映强烈。邵飘萍又发署名文章《敬诉诸世界各国之舆论》，指出，“巴黎和会名为主持公道，实已变为争权夺利之场。”“我国专使拒绝签字，具有万不得已之苦衷。”因为它“直接为损害我国领土完全，间接增加东亚极大危险”，“不仅为中国自身利害计，实为东亚前途安危计，即为今后世界和平生命计”，“我国拒绝签字自是正当防卫，不得不断然之处置”，以唤起世界各国国民的同情。同时，邵飘萍在《拒绝签约后之一致对外》一文中，又忠告当局再不要“内讧不已”，“宜速复统一之组织，方可以言对外。否则签字不签字，皆将成为无意味之举动，且更增国家之危险”。