文章最后说：“现在‘四人帮’及其资产阶级帮派体系已被摧毁，但是‘四人帮’加在人们身上的精神枷锁，还远没有完全粉碎。毛泽东同志在第二次国内革命战争时期曾经批评过的‘圣经上载了的才是对的’这种倾向依然存在。无论在理论上或实际工作中，‘四人帮’都设置了不少禁锢人们思想的禁区。对于这些禁区，我们要敢于去触及，敢于去弄清是非。科学无禁区。凡有超越于实践并自奉为绝对的禁区的地方，就没有科学，就没有真正的马列主义毛泽东思想，而只有蒙昧主义、唯心主义、文化专制主义。”

“躺在马列主义毛泽东思想的现成条文上，甚至拿现成的公式去限制、宰割、裁剪无限丰富、飞速发展的革命实践，这种态度是错误的。我们要有共产党人的责任心和胆略，勇于研究生动的实际生活，研究现实的确切事实，研究新的实践中提出的新问题。”

《实践是检验真理的唯一标准》一文在《光明日报》公开发表后，立即引起强烈反响。第二天，新华社全文播发，《人民日报》《解放军报》等报纸全文转载；全国35家省市级大报，两天内有25家转载。到5月底，全国已有30多家报纸转载。

就在《人民日报》转载的5月12日夜晚11点，正在值夜班的《人民日报》总编辑，接到了毛泽东主席著作编辑出版委员会办公室一位领导同志严厉的电话批评。

这个电话，不仅曲解了《实践是检验真理的唯一标准》的原意，而且上纲为“砍旗”，一再说“在政治上很坏很坏”，从另一个角度认为真理标准问题不仅涉及理论思想上的是非，而且是一个严重的政治问题。

值完夜班、看完5月13日大样的《人民日报》总编辑，即向胡耀邦电话简要通报了此事。胡耀邦认为这是重大争论，当即于5月13日下午在家里召集中央党校《理论动态》编辑组成员，以及《人民日报》总编辑等来讨论。胡耀邦对那句“在政治上要砍倒毛泽东思想这面红旗，是很坏很坏的”断语感触很多。他激动地说：我多少年都是在毛主席直接领导下工作，对毛泽东的著作和思想，我自己是反反复复学习，真可以说达到过“无限信仰、无限崇拜”的程度，但是对他老人家的缺点错误提出一点不同的看法，怎么就上纲成是反对他老人家呢？把学术争论一下子上升到政治上，这个风气再不改变怎么得了呀！在这个会上，胡耀邦对大家说，我们的《理论动态》要进一步办好。这几天我考虑了几个选题，一个是从真理越辩越明说起，讲清历史潮流是无法阻挡的，历史潮流滚滚向前。我们的民族经历了“文革”这场大灾难，反面教训是如此之深，在今后几十年，再重复这种灾难，倒退，人民通不过，这是不以某些人的意志为转移的。社会往往在倒退以后实现大跃进，这在世界和中国的历史上有许多这样的例子。我们必须写一篇文章，讲一下这个辩证法，把历史潮流怎么不可阻挡讲透一点。

5月18日，在中央召开的部分宣传和新闻单位负责人会议上，《实践是检验真理的唯一标准》一文被指责为“实际上把矛头指向毛主席思想”。各省主管宣传的负责同志还被告知：对《实践是检验真理的唯一标准》一文，不要以为《人民日报》转载了，新华社发了，就成了定论。

那些坚持“两个凡是”立场的人，给胡耀邦施加了很大的政治压力。他们采取各种方式，力图遏止真理标准问题讨论的展开。胡耀邦后来回忆这一段的情况时说：“那个时候的局面也确实不太明朗。”但是胡耀邦坚信历史潮流不可阻挡，他顶着巨大的压力，坚持组织撰写文章。