它将一支负有使命的专家队伍渗入到各州的教育部门中，去推进为白人和黑人建立公立学校的主张，并拨款来培训小学教师和督学。但不久后情况就显示，这些措施的利益大都流向白人儿童，而没有惠及黑人儿童，洛克菲勒对委员会提出了有礼貌但很强烈的抨击，要求他们迅速纠正不公平的做法。委员会为此专门拨款给南方各州的教育部门，让他们聘用一些全职的专员来改进黑人学校的工作。

不久以后，委员会认识到要发展公立学校体制，政府必须有足够的税收，于是开始广泛地向农村地区的贫困宣战。它在全区引进了农业试验和农场示范，其中一些项目后来为联邦政府所接管或支持。

1912年以后，这个普及教育委员会又开展了一个大规模的项目：全面审视并提高美国的医学教育，因为当时这方面远远落后于欧洲学校的水准。委员会之所以作此决定，是基于亚伯拉罕·弗莱克斯纳(Abraham Flexner)在安德鲁·卡内基赞助下所提出的一份爆炸性的报告，这份报告揭露了当时美国医学院校极其严重的不健全状况。委员会为这项医学教育改革项目耗资数千万美元，它也许是美国公益事业历史上首屈一指、最令人瞩目的成就。

1909年，普及教育委员会还建立了一个分支机构——洛克菲勒卫生委员会，去根除南方的钩虫病害。事情的起因是委员会的领导人华莱士·巴特里克（Wallace Buttrick)博士在一次旅行中，遇到了公共卫生部门的官员、研究钩虫病的权威C.W.斯泰尔斯（C.W.Stiles)医生。后者有力地证明这种病是可以治愈也是可以预防的，而且花费不大。巴特里克被说服了，就去找盖茨，盖茨又去找了洛克菲勒。经过一年时间的仔细研究，洛克菲勒拿出了一大笔捐款组成了这个新的委员会。此后的5年里，委员会着手防治这一祸及千家万户、上百万人口的病害。到1915年，这个项目的最后报告说明，在整个南方，治疗及预防钩虫病的任务已经胜利完成。

当这项重大任务尚在实行之时，盖茨已经把目光投向前方，要创建一个大规模的新的洛克菲勒信托基金，以“促进全球人类的福利”。洛克菲勒在1909年即表明，他已准备把这一设想付诸实践。创办医学研究所和普及教育委员会过程中所取得的经验使他确信，把大笔经费托付给一个由专家和具有治国才能的人士组成的独立委员会，是能够取得显著成效的。他有机会结识了一些行政人才，除了巴特里克，还有威克利夫·罗斯（Wycliffe Rose)博士，他对这位前哲学教授赋予充分信任。

于是，洛克菲勒以自己一贯井井有条、实事求是的方式，为这项他一生中最后的，也是顶峰的公益事业做好了人事安排，来着手创办头一个全球性的大公益基金会。他于1909年就投入5000万美元建立了信托基金，但由于当时洛克菲勒在社会上声誉不佳，经过三年的政治辩论洛克菲勒基金会才得以注册。一经注册，这个新的机构便发起了一系列雄心勃勃的项目。以原来的卫生委员会为蓝本而建立的国际卫生部，开始在全球范围先后展开消灭钩虫病、疟疾、黄热病及其他传染病的运动，并取得了引人注目的成功。它在中国的医学委员会创建了规模巨大的北京协和医学院，成为在亚洲传播现代西方医学知识的中心。

接着，洛克菲勒基金会又致力于推动在美国和海外建立处理公共卫生问题的永久性的政府机制。借助于基金会的力量，国内外第一批重要的公共卫生学校和公共卫生护士学校相继建立起来。

到了20世纪20年代初，这种爆发性的巨大创造力开始减退。盖茨退休了；洛克菲勒此时已年过八旬，开始脱身出来享受家庭生活和高尔夫运动之乐，并照料自己的投资。最后，他死于1937年，享年98岁。